電子書的格式有相當多,有 Kindle 的專用格式 azw、Windows Mobile 和 Palm 手機上見到的 mobi 格式、Sony Reader 的專有格式 BBeB ...,不過目前流通最廣,還是屬 ePub 格式及最常見的 txt、html 和 PDF 等。想要製作 ePub 電子書時,可以透過 Calibre 這套免費工具來製作,支援眾多格式,像是 PDF、lrf 、Html、txt、Mobi、Cbz...等數十種格式之外,另外 Calibre 也是一套相當優秀的電子書管理及 ePub 閱讀器軟體。